用于目标基因组修饰的锌指核酸酶（ZFN）能够以蛋白质的形态穿透细胞膜，这是近期《自然—方法学》上一项研究得出的结论。这将让ZFN被投递至细胞内的过程变得更简单、更具安全性。

经过设计的核酸酶比如ZFN，能够让多个种类的基因组产生特定变化，其对研究和基因疗法的辅助作用让人眼前一亮。核酸酶一般是被以DNA或RNA的形态投递进入细胞内，然后产生功能蛋白。

Carlos Barbas等人报告称，他们在几种哺乳动物细胞中观察到ZFN蛋白自身能够穿透细胞膜。当ZFN蛋白在细胞内达到足够高的浓度时，便会产生特定基因组变化，其效果和ZFN以DNA形态投递是一样的。虽然此前曾认为细胞膜的渗透作用只针对一小部分类型的蛋白质和肽而言，而未曾有研究证明ZFN也会用到这种作用。

和ZFN以DNA形态投递相比，ZFN蛋白在目标细胞内只会短暂存在并且其在基因组变化中所产生的脱靶效应要低得多。蛋白投递可以避免在投递过程中由病毒引起的插入突变风险以及由细胞对外源DNA的应答而引起的细胞中毒风险。